Je vergelijkt appels en peren.
MSSQL is een database-beheersysteem en is te vergelijken met MySQL, ook een database-beheersysteem.
Phpmyadmin is een tool die het makkelijker maakt om met de database te werken,
een interface zogezegd, of een dashboard.
In principe kan er samengewerkt worden tussen MSSQL en PHP
(ik wist het ook niet zeker, maar 1 zoekactie op Google levert voldoende antwoord op).
Let op: ik zeg PHP. Niet Phpmyadmin.
PHP is een scripttaal; phpscripts kunnen dus samenwerken met MSSQL.
Phpmyadmin is een tool, een applicatie. Of deze makkelijk met MSSQL is te koppelen, zou je op Google moeten opzoeken.