Waterkoeling is zeker niet de beste manier.
Je hebt eerst en vooral de extreme vormen van koeling, dan denk ik aan vloeibaar stikstof of droog ijs, daarmee bereik je temperaturen tot -192°, maar dat is uiteraard niet geschikt als permanente koeling.
Volgende stap zijn de phase-change systemen, deze werken met een compressor, net als je diepfries (sorry BrEeZeR

). Deze zijn ook gecommercialiseerd, denk maar aan Prometeia en VapoChill. Ze kosten helaas wel veel, denk aan 600 euro. Je bereikt er wel temperaturen van -40 tot -20 mee, en het is geschikt voor permanent gebruik.
Vervolgens heb je peltier-koeling. Peltiers zijn thermische elementen die de warmte heel snel kunnen doorsturen, zodat je een koude en een warme kant hebt. Het verschil tussen de koude en warme kant kan, mits de warme kant goed gekoeld is uiteraard, wel 60° zijn. Met een peltier kan je temperaturen tussen -10 en 10° bereiken. Het nadeel is wel dat je een peltier heel goed moet koelen - met een heel, heel lompe luchtkoeler, of een waterkoelingsysteem.
En dan pas komt waterkoeling. Waterkoeling is niet zoveel beter dan luchtkoeling hoor.. Het nadeel van luchtkoeling is dat de hele heatsink op je CPU moet staan, je hebt dus beperkte plaats. Het idee achter waterkoeling is 'verplaats de warmte naar een andere plaats', en die andere plaats is dus een (grote) radiator, en de warmte wordt vervoerd door het water. Maar nogmaals: je moet geen wonderen verwachten van waterkoeling. Het is gewoon een mooie manier, vooral als je stilte wilt (en daarvoor zijn die goedkope setjes dus nuttig, stilte, voor de koeling moet je het niet doen). Waterkoeling kan trouwens heel goedkoop zijn: een radiator van de autosloop, pomp van de aquariumzaak etc.